南通市第三人民醫(yī)院院始建于1962年，前身為南通市傳染病防治院。目前已發(fā)展成為集醫(yī)教研于一體的三級甲等醫(yī)院，南通大學(xué)附屬南通第三醫(yī)院，南京中醫(yī)藥大學(xué)南通中西醫(yī)結(jié)合臨床醫(yī)學(xué)院，全國綜合醫(yī)院中醫(yī)藥工作示范單位、國家級住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地，附設(shè)南通市肝病研究所、皮膚病研究所。
醫(yī)院目前編制床位1000張，實(shí)際開放床位近1200張，擴(kuò)建工程二期項目完成后，開放床位將達(dá)1600張?，F(xiàn)有職工1300余人，占地面積51682平方米，建筑面積近7萬平方米。設(shè)有2個門診部、49個臨床醫(yī)技科室、3個緊密型醫(yī)聯(lián)體，3個社區(qū)衛(wèi)生服務(wù)站。擁有省級臨床重點(diǎn)專科3個，2個市級臨床醫(yī)學(xué)中心，9個市級醫(yī)學(xué)重點(diǎn)學(xué)科，1個市級臨床醫(yī)學(xué)創(chuàng)新團(tuán)隊，25個市級臨床重點(diǎn)?？?，12個基層特色孵化中心。傳染病學(xué)連續(xù)3年進(jìn)入中國醫(yī)院科技量值排行榜100強(qiáng)。2017年牽頭組建南通市傳染病防治聯(lián)盟、2017-2019年作為主要發(fā)起單位組建江蘇省肝健康聯(lián)盟、傳染病專科聯(lián)盟，成為長三角傳染病防治創(chuàng)新醫(yī)院聯(lián)盟核心成員單位，2019年建成復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院感染病國家重點(diǎn)學(xué)科南通基地。2020年成為中國公共衛(wèi)生聯(lián)盟成員單位。
醫(yī)院成功實(shí)踐“以專科為重點(diǎn)、綜合學(xué)科協(xié)調(diào)發(fā)展”的?？漆t(yī)院建設(shè)創(chuàng)新理論，同時創(chuàng)建全國首家政府命名的“無紅包醫(yī)院”并保持20余年如一日。2007年又在全國率先創(chuàng)建以“醫(yī)德高尚、醫(yī)術(shù)精湛、醫(yī)患和諧、醫(yī)境優(yōu)美、醫(yī)文醇厚”為目標(biāo)的“白求恩式醫(yī)院”取得明顯成效。先后獲“全國文明單位”“全國職工職業(yè)道德建設(shè)十佳單位”“全國先進(jìn)基層黨組織”“全國五一勞動獎狀”“全國衛(wèi)生系統(tǒng)先進(jìn)集體”“全國醫(yī)德建設(shè)先進(jìn)集體”“全國衛(wèi)生系統(tǒng)思想政治工作先進(jìn)單位”等多項國家級榮譽(yù)，成為衛(wèi)生系統(tǒng)職業(yè)道德建設(shè)的一面旗幟。