仁濟醫(yī)院建于1844年，是上海開埠后第一所西醫(yī)醫(yī)院。醫(yī)院目前由東西南北四個院區(qū)和上海市腫瘤研究所組成，是一個學科門類齊全，集醫(yī)療、教學、科研于一體的綜合性三級甲等醫(yī)院：東院區(qū)位于浦東陸家嘴金融貿易區(qū)內，于1999年10月建成投入使用，占地86，875m2，建筑面積207，740.74m2；西院區(qū)位于黃浦區(qū)中央商務區(qū)內，毗鄰外灘，占地7，811m2，建筑面積39，014.83m2；南院區(qū)位于閔行區(qū)浦江鎮(zhèn)，于2012年12月建成投入使用，2020年10月20日整建制并入仁濟醫(yī)院，占地50，055m2，建筑面積82，590m2；北院區(qū)位于巨野路靈山路，占地6，744m2，建筑面積17，553.82m2，于2013年7月全面啟用；腫瘤所位于斜土路，總建筑面積7，523m2，由癌基因與相關基因國家重點實驗室、腫瘤流行病學研究室、十一個相關的研究課題組、輔助部門公共服務平臺與《腫瘤》雜志編輯部組成，于2010年10月與仁濟醫(yī)院正式“院所合一”，2019年完成整體轉隸，目前由市教委委托上海交通大學醫(yī)學院管理，具體事務由仁濟醫(yī)院負責。
截至2020年底，醫(yī)院共設有53個臨床醫(yī)技科室，總核定床位2750張；共有正式職工4390人，其中正、副高級職稱專家587名，博導136名、碩導166名。仁濟醫(yī)院在2019年度醫(yī)院綜合實力排名榜（復旦版）中位列全國第十五名，在全國醫(yī)院?？坡曌u排名中，醫(yī)院消化內科排第二，風濕免疫科排第三，變態(tài)反應科排全國第四、麻醉科排全國第六，泌尿外科排第七，核醫(yī)學科、生殖醫(yī)學科排全國第十，腎內科、神經(jīng)外科、婦產科、放射科、普通外科、檢驗醫(yī)學、健康管理等學科均獲提名，處于國內領先地位，部分領域達國際先進水平。
近年來，醫(yī)院申請到的科研項目及專利逐年遞增，包括國家級的973計劃、863計劃、國家自然基金（重大、重點、創(chuàng)新研究群體）項目等，其中2020年科研經(jīng)費近3億元。醫(yī)院還獲得多項國家科技進步獎、中華醫(yī)學科技獎、高等學校科技進步獎等；先后共有幾百人次入圍各級人才培養(yǎng)計劃，包括973首席科學家、長江特聘教授、衛(wèi)生部有突出貢獻中青年專家、國家杰出青年、上海市領軍人才等。醫(yī)院與加拿大、英國、美國、法國、比利時、德國、瑞士、挪威、澳大利亞、馬來西亞等近十個國家的二十多所醫(yī)學院校建立了學術交流和友好合作關系。在施普林格·自然集團發(fā)布的2021年全球醫(yī)療機構“自然指數(shù)”百強榜中，仁濟醫(yī)院論文相關指標位列全球排名第22名，處于全國第一。