上海市口腔醫(yī)院始建于1946年，時名上海牙病中心防治所，是上海最早的公立口腔醫(yī)療機構。自上世紀50年代起，受上海市衛(wèi)生健康委員會委托，指導全市口腔病防控工作，擁有全國最完整的口腔公共衛(wèi)生三級防治網絡，是本市口腔科普總召集人單位。1998年更名為上海市口腔病防治院；2015年復旦大學與上海申康醫(yī)院發(fā)展中心簽約共建復旦大學附屬口腔醫(yī)院；2021年更名為上海市口腔醫(yī)院，加掛上海市口腔健康中心牌子；2021年成立復旦大學口腔醫(yī)學院，依托上海市口腔醫(yī)院建設?，F已成為醫(yī)療、教學、科研、預防全面發(fā)展，醫(yī)防融合特色鮮明的口腔醫(yī)院、口腔醫(yī)學院、口腔醫(yī)學研究及口腔健康管理機構。
醫(yī)院設有北京東路院區(qū)、復興中路院區(qū)、浦錦院區(qū)、永嘉路門診部、天津路科研教學中心及建筑面積5萬平方米的新院，擁有綜合治療椅580臺，病床100張，年門急診服務量80余萬人次，為上海體量最大的口腔醫(yī)療中心，是上海市口腔質量控制中心分中心，牽頭上海市口腔病防治聯合體及復旦大學口腔醫(yī)療聯合體。
醫(yī)院是中國牙病防治基金會副理事長、中華口腔醫(yī)學會常務理事、中國衛(wèi)生信息與健康醫(yī)療大教據學會常務理事、上海市口腔醫(yī)學會副理事長、上海市醫(yī)師協會口腔醫(yī)師分會副理事長及國際牙科研究學會（IADR）中國委員會委員單位。現有職工561人，柔性引進或雙聘國家級領軍人才5人，擁有國務院政府特殊津貼專家1人、國家臨床重點?？曝撠熑?人，上海醫(yī)務工匠、上海市優(yōu)秀學術帶頭人等省部級卓越人才13人；全國各專業(yè)委員會主任委員1人，副主任委員6名，上海市各專業(yè)委員會主任委員5名，副主任委員15人。
復旦大學口腔醫(yī)學院依托上海市口腔醫(yī)院建設，擁有口腔醫(yī)學學士、碩士、博士專業(yè)學位授權點及博士后流動站，博士研究生導師21人，碩士研究生導師18人；是國家住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地和上海市?？漆t(yī)師培訓基地，“5+3+X”口腔醫(yī)學人才培養(yǎng)體系建成貫通。
醫(yī)院建有國家臨床重點?？?、上海市重中之重研究中心、上海市顱頜面發(fā)育與疾病重點實驗室、復旦大學口腔醫(yī)學院口腔融合創(chuàng)新研究院，是“國家口腔疾病臨床醫(yī)學研究中心”北京大學、上海交通大學、四川大學分中心，國家醫(yī)療器械臨床試驗機構GCP中心，全國口腔醫(yī)學創(chuàng)新平臺發(fā)起單位之一。與哈佛大學、紐約大學、墨爾本大學、香港大學等知名院校深度合作，每年舉辦大型國際及全國性學術會議，參加國際口腔領域學術會議交流并做大會發(fā)言，2023年軟科中國大學口腔醫(yī)學專業(yè)排名B+。獲中華醫(yī)學科技進步二等獎、教育部科技進步二等獎、中華口腔醫(yī)學會口腔醫(yī)學創(chuàng)新成果獎、中國衛(wèi)生信息與健康醫(yī)療大數據學會中國智慧健康醫(yī)療創(chuàng)新成果獎和優(yōu)秀成果獎、上海市決策咨詢研究成果三等獎及上海市預防醫(yī)學會科學技術二等獎。
醫(yī)院以全面加強黨的建設為引領，爭創(chuàng)全國文明單位，以上海市口腔醫(yī)院新院和復旦大學口腔醫(yī)學院建設為契機，以高水平創(chuàng)新推動高質量發(fā)展，為建設成為國內頂尖、國際知名的口腔醫(yī)院和口腔醫(yī)學院而努力奮斗。